Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syngr4Q9Z1L2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syngr4Q9Z1L2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms