Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl8Q9Z121 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms