Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1a4Q9WV27 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1a4Q9WV27 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms