Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms