Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms