Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms