Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b2Q9JME5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b2Q9JME5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms