Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tlr5Q9JLF7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms