Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsmQ9JL96 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms