Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms