Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pus3Q9JI38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms