Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ClpxQ9JHS4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ClpxQ9JHS4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ClpxQ9JHS4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ClpxQ9JHS4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms