Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tmod3Q9JHJ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tmod3Q9JHJ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Tmod3Q9JHJ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Tmod3Q9JHJ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Tmod3Q9JHJ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod3Q9JHJ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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