Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms