Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms