Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms