Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms