Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms