Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms