Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms