Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms