Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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