Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ist1Q9CX00 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ist1Q9CX00 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms