Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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