Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx2Q9CWK8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms