Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd3Q9CRB9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms