Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd9Q9CR00 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms