Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms