Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc18Q9CQ07 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms