Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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