Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms