Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm2d1Q99MB3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm2d1Q99MB3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm2d1Q99MB3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm2d1Q99MB3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm2d1Q99MB3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm2d1Q99MB3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm2d1Q99MB3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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