Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms