Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms