Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf19Q99KP6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms