Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms