Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms