Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms