Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot3Q8K0V4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms