Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap29Q8CGF1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms