Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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