Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Aph1bQ8C7N7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aph1bQ8C7N7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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