Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsper4Q8BVN3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms