Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms