Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SynprQ8BGN8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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