Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ubash3bQ8BGG7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms