Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms