Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncripQ7TMK9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms