Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms