Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms